Organisaatio
Pesäpuu ry on yhdistys, jonka kotipaikka on Jyväskylä ja toimialueena koko maa. Yhdistyksellä on sivutoimisto Helsingissä. Yhdistyksen päättävä elin on yhdistyksen vuosikokous. Yhdistyksen asioita hoitaa hallitus, johon kuuluu 7–10 varsinaista ja heidän varajäsenensä.

Pesäpuun hallitus 20.5.2011-
| Puheenjohtaja | |||
| Tarja Heino | Terveyden ja hyvinvoinnin laitos | ||
| Jäsen | Varajäsen | ||
| Pirjo Hakkarainen | Perhehoitoliitto ry | Hannu Piispanen | Perhehoitoliitto ry |
| Riitta Hyytinen | Pelastakaa Lapset ry | Saara Keränen | Pelastakaa Lapset ry |
| Aarno Laitila | Jyväskylän yliopisto | Mirja Satka | Jyväskylän yliopisto |
| Paula Marjomaa | Pelastakaa Lapset ry | Raija Maula | Pelastakaa Lapset ry |
| Tiina Pitko | Perhehoitoliitto ry | Hanna Hakala | Perhehoitoliitto ry |
| Aila Puustinen-Korhonen | Suomen Kuntaliitto | Tarja Pitkänen | Pohjois-Savon lastensuojelun kehittämisyksikkö |
| Paula Pollari-Urrio | Jyväskylän kaupunki | Anne Seppälä | Jyväskylän kaupunki |
| Tuula Saarnio | Laurea ammattikorkekoulu | Tuija Raitanen |
Pohjois-Savon lastensuojelun kehittämisyksikkö |
| Jaana Tervo | Lapsiasiavaltuutetun toimisto | Johanna Kiili |
Lapsiasiavaltuutetun toimisto |
| Marjo Varsa | Talentia ry | Päivi Mäkinen | Talentia ry |




